利用网格环境和网格计算资源,提供新药虚拟筛选服务和药物化学信息服务,
这就是新药研发应用网格。 新药研制的核心之一是从大量的化合物样品库中发现有药理活性的化合物。通常从10000个化合物中筛选出有药理活性的化合物不到1个。只有建立庞大的供筛样品库,才能保证新药可以源源不断的开发出来,保证新药研发的可持续发展。国际上大医药公司通常有几十至上百万的化合物实物样品库,可提供自动化的药物筛选。而我国可用于药物筛选的化合物非常缺乏,这严重影响新药发现进程。
利用高性能计算机进行虚拟药物筛选是一条崭新的途径。首先通过计算机筛选化合物数据库,
可使得实际筛选的化合物集中上千倍。由于计算机药物筛选具有非常好的应用前景和经济社会效率,以及庞大的计算要求,迫切需要新一代的计算技术予于支撑。通过建立针对因特网环境的高效通信模式,应用网格格点内和格点间的双重负载平衡技术,最大限度的利用国家网格的空闲计算资源, 新药研发应用网格平台为用户提供高吞吐量和安全的新药筛选服务。
目前,上海、北京和香港的多个超级计算机和计算机机群等计算资源加入到本应用网格平台,形成了
超过每秒万亿次浮点运算能力; 同时本平台配备了200多万化合物三维结构和药物信息数据库资源,提供用户使用。截止到目前,已有抗糖尿病、抗关节炎等新药研究项目正在利用本网格平台进行计算机药物筛选,相关研究成果已经申请了3项新药发明专利。
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